独立核算分公司可以签订合同。根据《民法典》第四百六十九条，当事人订立合同，可以采用书面形式、口头形式或者其他形式。书面形式是合同书、信件、电报、电传、传真等可以有形地表现所载内容的形式。以电子数据交换、电子邮件等方式能够有形地表现所载内容，并可以随时调取查用的数据电文，视为书面形式。
因此，无论是分公司还是总公司，只要具备签订合同的主体资格，且合同内容不违反法律规定，双方达成合意，就可以签订合同。
请注意，在签订合同时，应确保合同条款明确、具体，以避免可能产生的纠纷。如有需要，建议咨询专业律师以获取更详细的法律建议。
