在准备起诉北京合作协议纠纷时，您需要遵循以下步骤：
1. 确定管辖法院：
- 根据《民事诉讼法》的规定，合同纠纷案件可以由被告住所地或者合同履行地人民法院管辖。
- 如果合同中有约定管辖法院，应优先遵循合同约定。
2. 收集证据：
- 收集与合作协议相关的所有文件和通信记录，包括但不限于合作协议文本、补充协议、会议纪要、电子邮件、短信、微信聊天记录等。
- 准备证明对方未履行或未完全履行合同义务的证据，如违约行为的通知、损失计算等。
3. 撰写起诉状：
- 起诉状应包括以下内容：原告和被告的基本信息（如姓名、地址、联系方式）、诉讼请求（明确要求对方承担的责任）、事实与理由（详细叙述合作过程、出现的问题及原因）以及证据清单。
- 诉讼请求应具体、明确，如要求支付违约金、赔偿损失、继续履行合同等。
4. 提交起诉材料：
- 将起诉状和相关证据材料整理成册，按照法院要求填写起诉状提交清单。
- 提交至选定的管辖法院，并根据法院要求缴纳诉讼费用。
5. 等待法院受理与通知：
- 法院收到起诉状后，将进行审查，符合立案条件的，予以立案并通知原告。
- 如不符合立案条件，法院会作出不予受理的裁定，原告可针对该裁定提起上诉。
6. 参加庭审：
- 按照法院通知的时间和地点参加庭审，陈述事实、提供证据，并回答法官的问题。
- 如需委托代理人代为诉讼，应提前准备好授权委托书及相关证件。
7. 等待判决与执行：
- 法院审理结束后，将依法作出判决。
- 如判决支持原告的诉讼请求，对方未履行判决的，原告可申请法院强制执行。
请注意，以上流程仅供参考，具体操作可能因地区和案件性质而有所不同。建议在起诉前咨询专业律师以获取更详细的法律建议。
