在处理境外机构在国内进行起诉主体资格授权书公证认证的事宜时，通常需要准备和提交以下文件：
1. 授权委托书：这是境外机构出具的，委托其国内代理人代表其进行诉讼活动并签署相关文件的文件。该文件应详细说明授权事项、授权期限等关键信息。
2. 身份证明文件：境外机构的有效护照、签证或居留许可等身份证明文件，以证明其身份和在我国境内的合法地位。
3. 法定代表人身份证明文件：如果授权委托书由境外机构的法定代表人签署，还需要提供法定代表人的身份证明文件。
4. 国内代理人的身份证明文件：国内代理人的身份证、户口本等身份证明文件，以证明其与境外机构之间的关系以及其在诉讼中的角色。
5. 授权范围说明：在授权委托书中明确说明授权范围，包括授权地域、事项、期限等，以便国内代理人在诉讼中准确行事。
6. 公证认证申请表：向公证处或认证机构提交的申请表格，说明需要公证认证的具体事项和要求。
7. 其他相关文件：根据具体情况，可能还需要提供其他相关文件，如合同、协议、证明文件等。
请注意，不同国家和地区的公证认证要求可能有所不同。因此，在准备和提交文件之前，建议先咨询当地的律师或法律服务机构，了解具体的公证认证要求和流程。此外，公证认证过程可能需要一定的时间和费用，请做好相应的准备。
