旷工三天导致自离，是否有工资需要根据具体情况来判断。
首先，如果员工有正常上班，则单位应当按照劳动合同的约定支付工资。如果员工没有正常上班，可能需要根据公司的规章制度来处理。通常情况下，公司会扣除相应的工资或费用，但这需要确保公司的规章制度合法且合理，并且扣除的金额不得超过员工当天的工资。
其次，如果员工旷工三天被公司开除，那么公司是否需要支付经济补偿金或赔偿金取决于解除劳动关系的原因。
1. 如果公司合法开除员工，例如员工严重违反公司的规章制度等，那么公司无需支付经济补偿金，但可能需要支付相应的赔偿金（如果员工已经工作满一年）。
2. 如果公司违法开除员工，例如没有合法依据或违反法定程序等，那么公司需要向员工支付经济赔偿金，赔偿标准是经济补偿金的二倍。
另外，根据《工资支付暂行规定》第十六条：因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20％。若扣除后的剩余工资部分低于当地月醉低工资标准，则按醉低工资标准支付。
因此，员工旷工自离后，公司应依法依规扣除相应的工资或费用，不得随意克扣。
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