股东严重纠纷在特定情况下是可以申请公司清算的。
根据《中华人民共和国公司法》的相关规定，当公司经营管理发生严重困难，继续存续会使股东利益受到重大损失，通过其他途径不能解决的，持有公司全部股东表决权百分之十以上的股东，可以请求人民法院解散公司。而公司解散，应当由公司的董事会或执行董事、监事会或监事向公司登记机关申请注销登记。
此外，如果公司经营管理发生严重困难，继续存续会使股东利益受到重大损失，通过其他途径不能解决的，比如股东之间、公司董事之间、公司债权人之间以及公司与其股东之间的矛盾激化到一定程度，公司继续存续将严重损害股东利益，且无法通过其他方式解决，那么持有公司全部股东表决权百分之十以上的股东，可以请求人民法院解散公司。
在申请清算时，需要成立清算组，开始清算。并依照法定程序，清理公司债权债务，处理公司剩余财产，并按照法定顺序进行分配。
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