刑事拘留后，民事赔偿部分可以私下协商并达成一致，但这并不代表刑事程序可以撤销或结束。刑事案件的侦查、起诉和审判是独立的，不受民事赔偿协议的影响。
根据《刑事诉讼法》的规定，一旦公安机关、人民检察院或人民法院受理刑事案件，即使当事人之间达成了民事赔偿协议，该案件仍然需要继续侦查、起诉和审判。如果双方希望撤销案件，必须经过公安机关、人民检察院或人民法院的同意，并按照相应的法律程序进行。
此外，《刑事诉讼法》规定，犯罪嫌疑人、被告人自愿如实供述自己的罪行，承认指控的犯罪事实愿意接受处罚的，可以依法从宽处理。即使双方达成和解协议，也不能影响司法机关依法办案。
因此，刑事拘留后私了并不能撤销案件，但可以在法律允许的范围内进行和解，以促进案件的妥善处理。
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