当案件已经过了追诉时效期限，可以采取以下几种处理方式：
1. 不予起诉：根据《刑事诉讼法》第十六条规定，犯罪已过追诉时效期限的，不追究刑事责任，已经追究的，应当撤销案件，或者不起诉，或者终止审理，或者宣告无罪。因此，对于已过追诉时效的案件，检察机关不会向法院提起公诉。
2. 撤销案件：如果案件存在法律手续不完备或者需要补充材料的情况，可以由公安机关或人民检察院依法撤销案件。
3. 不起诉：对于不构成犯罪的案件，人民检察院可以根据具体情况作出不起诉的决定。
4. 终止审理：在审判阶段，如果发现案件已经超过追诉时效期限，法院应当裁定终止审理。
5. 宣告无罪：在审判阶段，如果被告人被控犯罪的事实确实存在，但已过追诉时效期限，法院可以宣告被告人无罪。
6. 重新计算追诉时效：在某些情况下，如犯罪嫌疑人、被告人因逃避追诉而隐匿，导致追诉时效期限中断，待其重新出现后，追诉期限可以从其出生之日起计算。
7. 追诉期限的计算：追诉期限从犯罪之日起计算；犯罪行为有连续或者继续状态的，从犯罪行为终了之日起计算。
需要注意的是，追诉时效期限的法律规定可能因国家和地区的不同而有所差异，上述处理方式仅供参考。在实际操作中，应根据具体国家或地区的法律法规进行处理。如有疑问，请咨询专业律师。
