依据法律认定被告人有罪的人民法院应当作出以下判决：
1. 有罪判决：当法院经过审理，认为指控的犯罪事实清楚，证据确实、充分，且被告人依法应当被追究刑事责任时，应当作出有罪判决。这意味着法院认定被告人犯有指控的罪行。
2. 判决宣告：作出有罪判决后，法院应当在判决书中明确告知被告人及其法定代理人、辩护人、诉讼代理人在判决发生法律效力前有权提出上诉。如果被告人或其亲属对一审判决不服，可通过上诉等程序要求法院重新审判。
此外，根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的规定，人民法院在作出判决时还需注意以下几点：
* 证据确实、充分：这是指定罪量刑所依据的各种证据必须是客观真实、确实充分的，而且证据之间要相互印证、相互支持，不能存在矛盾或漏洞。
* 犯罪事实清楚：即对犯罪行为的具体情节、性质、危害后果等要有明确的认定，确保案件事实清楚、证据确凿。
* 法律适用正确：即在认定案件事实的基础上，正确地适用了相关的法律条款，对被告人进行了公正的处罚。
总之，依据法律认定被告人有罪的人民法院应当作出有罪判决，并在判决书中告知相关当事人的上诉权利。
