内蒙古自治区拘捕的主要差异可能体现在以下几个方面：
1. 法律依据不同：拘捕的依据可能是《中华人民共和国刑事诉讼法》或《中华人民共和国公安机关办理刑事案件程序规定》等相关法律法规。不同地区可能会根据当地的实际情况和法律规定，对拘捕的条件、程序等做出一些具体的规定。
2. 拘捕对象不同：拘捕的对象通常是犯罪嫌疑人、被告人，但在某些情况下，也可能是证人、被害人等。在内蒙古自治区，拘捕的对象可能会根据当地的案件性质和社会治安状况而有所不同。
3. 拘捕程序不同：拘捕需要遵循一定的法律程序，包括立案侦查、刑事拘留、逮捕等环节。在不同地区，这些环节的具体操作可能会存在差异。例如，一些地区可能会实行集中办案、异地用警等机制，以提高办案效率。
4. 拘捕措施不同：拘捕的措施包括刑事拘留、逮捕等，不同地区可能会根据当地的实际情况和法律规定，对拘捕的措施做出一些具体的规定。例如，一些地区可能会实行取保候审、监视居住等措施，以保障被拘留人的合法权益。
此外，内蒙古自治区拘捕主要差异还体现在以下方面：
1. 法律授权：自治区公安机关在案件管辖范围内，可以依法直接决定拘传、取保候审、监视居住、拘留、逮捕等刑事强制措施。这是与普通省份的主要区别。
2. 办案协作：自治区与全国其他省市区公安机关建立了紧密的办案协作机制，在跨区域抓捕、侦破案件中发挥重要作用。
3. 信息化应用：内蒙古公安机关依托“大数据”“智慧公安”建设，在信息共享、分析研判等方面取得显著成效，为精准化、信息化作战提供了有力支撑。
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